বরগুনা জেলার বেতাগী উপজেলা সদর থেকে ১০ কিমি. (৬ মাইল) দূরে বিবিচিনি ইউনিয়নে এই মসজিদটি অবস্থিত। জানা যায়, ১৬৫৯ খ্রিষ্টাব্দে হযরত শাহ্ নেয়ামত উল্লাহ (র.) পারস্য থেকে এই এলাকায় ইসলাম প্রচারের উদ্দেশ্যে এসে বিবিচিনিতে এ মসজিদটি নির্মাণ করেন। তার কন্যা চিনিবিবি এবং ইসাবিবির নামানুসারে গ্রামের নামকরণ করা হয় এবং মসজিদটির নাম রাখা হয়েছে বিবিচিনি শাহী মসজিদ।
মসজিদের পাশে রয়েছে ৩টি কবর। যা সম্পূর্ণ ব্যতিক্রম ধর্মী। কবর ৩টি সাধারণ কবরের ন্যায় হলেও লম্বা ৭মিটার (২৩ ফুট)। এলাকাবাসীর মতে সেখানে চির নিদ্রায় শায়িত আছেন মসজিদের প্রতিষ্ঠাতা হযরত শাহ্ নেয়ামত উল্লাহ্ (র.) এবং তার কন্যা চিনিবিবি এবং ইসাবিবি।
সম্রাট আওরঙ্গজেবের রাজত্বকালে ১৭০০ খ্রিষ্টাব্দে হযরত শাহ্ নেয়ামত উল্লাহ্ (র.) পরলোকগমন করেন এবং মসজিদের পার্শ্বে তাকে সমাহিত করা হয়। উল্লেখ্য, প্রত্নতত্ত্ব অধিদপ্তর কর্তৃক মসজিদটি সংস্কার করা হয়েছে। দেশের অন্যতম প্রাচীন ও ঐতিহাসিক মসজিদ হিসেবে এটি পর্যটকদের নিকট আকর্ষণীয়।