খাজা ইউনুস আলী মেডিকেল কলেজ চৌহালি উপজেলায় সিরাজগঞ্জ জেলার বাংলাদেশের একটি বেসরকারি মেডিকেল কলেজ। এই মেডিকেল কলেজটি এনায়েতপুর হাসপাতাল নামেও পরিচিত।
মহান শাহ্ সূফী হযরত খাজা ইউনুস আলী এনায়েতপুরী (রহঃ) এর স্মরণে খাজা ইউনুস আলী (রহঃ) মেয়ের জামাই এম আমজাদ হোসেনের উদ্যোগে ১৯৯৫ সালের ১৬ নভেম্বর খাজা ইউনুস আলী মেডিকেল কলেজ হাসপাতালের ভিত্তিপ্রস্তর স্থাপন করা হয়। ২০০৪ সালের ১৭ মে বহির্বিভাগ গঠনের মাধ্যমে প্রতিষ্ঠানটি প্রথম কার্যক্রম শুরু হয়।
মহান সূফী হযরত খাজা ইউনুস আলী স্মরণে গ্রাম, পৌরসভা এবং প্রত্যন্ত অঞ্চলে সুবিধা বঞ্চিত মানুষদের স্বাস্থ্যেসবা প্রদান করা ; স্বাস্থ্যসবা এবং পরিছন্নতা বিষয়ে সমগ্র জনসাধারণকে সচেতন করা; দূষণমুক্ত পরিবেশে স্বাস্থ্য শিক্ষার জন্য স্নাতক ও স্নাতকোত্তর শিক্ষাপ্রতিষ্ঠান গড়ে তোলা; ইন্টারনেটের মাধ্যমে প্রত্যন্ত অঞ্চলে টেলিমেডিসিন শিক্ষা কার্যক্রমের সুবিধা প্রসার করায় এরি উদ্দেশ্য।